聚焦MRD|基于ctDNA的MRD检测重构
2025-09-12 12:19
皮下必先验统计分析手段是能用分开大panel核酸或者全核苷酸核酸必先获取每个病症的人性化更早表征接收者,为他们的设计具体来说的得心应手核酸panel,如Natera、Guardant Health、领星临床等公司的MRD探测产品。在必先验筛借助于的更早表征里,该手段但会在病症抽样里同时追踪多个残基,比如领星临床的MDR探测产品但会从每一病症的全核苷酸核酸结果里审核借助于20个SNV用来作MRD监测。在前述并不一定的0.02%丰度水准的精气液抽样里,单个表征其可追踪的更早表征批量只有4-5份,但是在多残基联合探测的手段里其可追踪的更早表征批量将进一步提高到90份,进一步提高了在抽样水准的探测敏感度。
相比于通过分开大panel完成探测或者审核表征残基,WES核酸可以为病症检借助于来得多可追踪表征残基用来作审核探测。在领星临床万人核酸数据的统计分析里辨认借助于,能用WES核酸结果可以在泛癌症肿群体里为97.8%的病症审核借助于≥20个SNV残基用来作人性化panel的设计和MRD探测。而改用大panel,如能用700+基因分开panel,其在泛癌症肿群体里只能为62.8%的病症审核借助于≥5个SNV残基用来作的设计或者统计分析,且有约5.8%的病症或许无法探测到可追踪表征导致不能进一步来作MRD监测。相比而言,改用“WES+残基的设计”MRD监测模式的可受惠群体比例极低。
▲ 绘借助于4 在万人数据里比较WES和panel检借助于的可追踪SNV数量
总之,ctDNA是诊断MRD监测的重要脊椎动物研究课题,无论是基于皮下必先验统计分析手段还是皮下未被辨认借助于统计分析手段,ctDNA核酸技术的发展在MRD探测技术的发展上早已随之而来了很多可喜的全面性。领星临床“WES+残基的设计”的MRD探测产品但会环绕着实现极低敏感度、极低纳异性、极低可受惠病症比例、极低的诊断指导实用价值,为诊断技术的发展带去福利。
注解:
1 吴一龙,陆舜,等. 非小肝细胞癌症症小分子存留皮下专家协商[J]. 循证临床,2021年6月末第21卷第3期
DOI:10.12019/j.issn.1671⁃5144.2021.03.001
2 Honoré, N.; Galot, R.; van Marcke, C.; Limaye, N.; Machiels, J.-P. Liquid Biopsy to Detect Minimal Residual Disease: Methodology and Impact. Cancers 2021, 13, 5364.
DOI:10.3390/cancers13215364
3 Trigg, Ricky M.; Shaw, Jacqui A.; Turner, Suzanne D. (2019). Opportunities and challenges of circulating biomarkers in neuroblastoma. Open Biology, 9(5), 190056–.
DOI:10.1098/rsob.190056
4 Wan, Jonathan C. M.; Massie, Charles; Garcia-Corbacho, Javier; Mouliere, Florent; Brenton, James D.; Caldas, Carlos; Pacey, Simon; Baird, Richard; Rosenfeld, Nitzan (2017). Liquid biopsies come of age: towards implementation of circulating tumour DNA. Nature Reviews Cancer, 17(4), 223–238.
DOI:10.1038/nrc.2017.7
5 Citation: Masfarré, L.; Vidal, J.;Fernández-Rodríguez, C.; Montagut,C. ctDNA to Guide Adjuvant Therapy in Localized Colorectal Cancer (CRC). Cancers 2021, 13, 2869.
DOI:10.3390/cancers13122869
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